《沙丘》最早出版于1965年，作者是法兰克·赫伯特，沙丘其实是一个叫做厄拉科斯的行星。这里环境恶劣，被沙漠覆盖，然而却是帝国最重要的资源——香料的唯一产地。香料也叫美琅脂，主要以其抗衰作用闻名于世，食用者会成瘾，眼睛变成深蓝色的伊巴德之眼。特殊的人可以借助香料获得预知能力。
故事设定在遥远的未来，由人类建立的封建帝国统治着众多行星。然而在这样一个庞大的星际帝国里，像人工智能这样的高科技却成为禁忌。原来很久以前，人类和有自主意识的机器人之间爆发了一场战争，史称芭特勒圣战，也叫做大骚乱。之后人工智能以及计算机这一类高科技就被全面禁止了。于是诞生了一些拥有特殊技能的人取代了这些科技功能。
比如宇航公会的领航员，他们是肉身星际导航仪，拥有一定的预知能力，总是能选择畅通无阻而且安全的航道。因为长期泡在香料里，这些人已经发生变异，有着鱼一样的外型。宇航公会垄断了整个帝国的航运，并且保持中立地位，行事非常隐秘低调。
而“门泰特”是一众人形自走计算机，他们通过训练达到惊人的计算和谋划能力，帝国各大家族几乎都有自己的门泰特军师和顾问。这些人嘴边通常有深红色的色斑，因为他们经常喝一种叫做纱芙的高热量饮料来提高脑力。
再有就是帝国里最重要同时也最神秘的组织“姐妹会”，她们的成员叫做贝尼·杰瑟里特，简称BG，她们有着极其敏锐的洞察力，是人形测谎仪。还拥有“音言”这种神技，可以通过语气语调给对手施加压力，达到完全控制对方的目的。此外，BG还有对自我身体生化反应的超强控制力，可以把吃进肚子里的毒药转化成无害物质，甚至还能决定自己生男生女。可怕的是这些都还是BG的雕虫小技，她们中的一些人通过考验就可以获得所有女性祖先留下的记忆，并且借助香料获得预知未来的能力。她们唯一的缺陷就是不能获得男性祖先的记忆，因此姐妹会有计划的和各个家族联姻，寻求一个基因解决方案，创造一个男性BG，他的精神和肉体之能可以穿越时空，即为“魁萨茨·哈德拉克”，意思是“捷径”。
生活在沙丘厄拉科斯的土著人叫弗雷曼人，因为长期接触香料，都有一双蓝眼睛。然而他们非但一点都不香，还个个臭气熏天，因为他们必须穿一种能够回收身体水分的“蒸馏服”，以适应沙丘缺水的环境。弗雷曼人非常的坚韧、凶悍，又特别迷信，长期反抗着帝国的压迫。
《沙丘》这部小说有一点像中国的《三国演义》，我指的不是对于战争或者权谋的描写，而是说这是一本不怕剧透的小说。《三国演义》的故事在中国可以说家喻户晓，谁都知道华容道的故事，谁都知道失、空、斩，但是这并不会降低读者阅读时的乐趣和美学感受。《沙丘》也是这样一部小说，作者赫伯特甚至在每一个章节的开头用一段类似史诗的伊勒琅公主的《穆阿迪布之歌》亲自剧透一下。他这样写就是把这部小说里的故事当做历史来书写，于是他能够把阴谋诡计的细节和谜底提前透漏给读者，然后仍然写出一种宏大且苍凉的感觉，这就是具有史诗感的写法。使得其他同类型的作品在《沙丘》的对比之下如同儿戏。
既然如此，那么剧透要开始了！
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第一部《沙丘》
小说一开始厄拉科斯还是哈克南家族的封地，哈克南男爵的侄子野兽拉班是这里的总督，他用非常残暴的手段压迫弗雷曼人。这时候帕迪沙皇帝沙达姆四世把厄拉科斯重新分封给了在兰兹拉德联合会的各大家族中颇孚众望的厄崔迪·雷托公爵。这件事看似是厄崔迪家族的大好事，实际上却是一个圈套。大家心里明白，皇帝对雷托公爵心生猜忌，打算联合哈克南家族铲除厄崔迪。哈克南和厄崔迪本来就是世仇，现在有了皇帝的支持就更加肆无忌惮了。弗拉基米尔·哈克南男爵一早就在厄崔迪家里安排了卧底，还制定了周密的计划，要把仇家一举歼灭。
除了卧底具体是谁，雷托公爵一方对这个圈套知道的一清二楚。但是，按照赫伯特的套路，就是无论对方使用什么阴谋诡计，我只有一条妙计，就是将计就计。当然，雷托还是做了准备的，为了对抗可能的敌人皇家精兵萨多卡，专门派人拉拢弗雷曼人作为盟友。但是，前面说了姐妹会有预知未来的能力，所以按照姐妹会的说法，这都是瞎忙活，你们厄崔迪肯定是要完蛋的。
厄崔迪一家刚搬到厄拉科斯就遭遇了一次针对雷托独子，也就是男主保罗的暗杀。有人在保罗房间里放了一支猎杀镖——一种浮空金属制飞镖武器，由人近程控制，是一种常见的暗杀工具。幸好保罗机智冷静，抓住并破坏了这个暗器。这件事证实了有卧底潜伏在他们身边。接下来又有一队哈克南雇佣兵冒充弗雷曼人袭击了他们，也被歼灭了。歼灭哈克南雇佣兵的就是雷托公爵的手下大将邓肯·艾达荷，他也是此前派去拉拢弗雷曼人的使者。邓肯成功获得了弗雷曼人的信赖。
雷托公爵的门泰特杜菲·哈瓦特认为卧底就是公爵的姬妾，保罗的生母杰西卡。这个杰西卡之所以不是雷托正式的妻子是因为作为家族领袖的雷托必须保持“单身”，好在必要的时候用联姻的方式摆脱困境或取得有利条件。其实按照姐妹会的计划，杰西卡本应该给公爵生一个女孩，这样就可以在必要的时候联姻，而且很有可能这个女孩联姻的对象就是厄崔迪的死敌哈克南家族的继承人菲德-罗萨。这样一来说不定就可以化解这场危机。但是杰西卡使用了BG强大的技能，控制自己的身体主动生出一个男孩。她说是因为她爱雷托公爵，而雷托公爵需要一个男孩来做继承人。同时杰西卡也想试一试自己是不是能生出姐妹会的终极目标魁萨茨·哈德拉克。
雷托对杰西卡是百分百信任的，但为了安抚人心，同时让敌人放松警惕，将计就计，他还是同意了杜菲的建议让邓肯去监视杰西卡。同时他私下里又跟保罗说，如果自己出了事，希望保罗告诉母亲，自己从来没有怀疑过她。
接下来保罗陪着雷托见到了弗雷曼人的领袖列特，此人原来是帝国派过来的环境专家，已经彻底融入了弗雷曼人，并成为他们的领袖。列特·凯恩斯的梦想是改造厄拉科斯的环境，让这里变成适宜人类生存的绿洲。在接触中，弗雷曼人开始觉得保罗就是传说中的指路之人，就是会带领弗雷曼人走向自由复兴的领导者。这都是姐妹会很久以前就设计好的，她们通过护使团在弗雷曼人的信仰里暗示了指路之人的特征，而这一切都和保罗吻合。
雷托公爵一方面针对哈克南的攻击做出一些部署，同时着手恢复香料生产。雷托改革了一些不太合理的传统，得罪了一些既得利益者。比如铲除哈克南的巢穴，将他们的财产充公，让皇帝获得10％的好处。雷托的行动每一步都合情合法。
然而，厄崔迪这一边很快就内讧了，杰西卡得知杜菲派邓肯监视自己，非常生气的找来杜菲对质，双方都没办法被彻底说服。然而，哈克南在当晚就动手了。卧底就是医生威灵顿·岳，他偷袭了雷托公爵。事先没人怀疑他是因为都知道岳是一位苏克学校的毕业生，经受了帝国预处理——这是一项苏克医学院开发的技术，制约人的杀人举动。受过处理的人员会在前额刺上钻石形刺青。而且岳的老婆被男爵害死了，男爵也正是利用这一点才找岳作为他们的卧底。
实际上岳有自己的计划，就是给雷托装一颗充满毒气的假牙，等他被带到男爵面前时，咬破假牙放出毒气跟男爵同归于尽。在岳看来，雷托公爵难逃厄运，能够作为刺杀仇人的武器也无不可。更何况岳还答应雷托公爵帮助杰西卡和保罗活下来。可惜男爵太机警了，提前开着屏蔽场，并且快速的躲到了一扇暗门后面。男爵的门泰特彼得还有其他手下就都被毒死了。
这里说一下屏蔽场，这是一种防御装备，在小说里通常安装在腰带上，打开开关就会在身体周围形成类似电磁场的保护层，可以阻挡快速的物体靠近，但是不能阻挡缓慢的物体。所以在《沙丘》的世界里通常不会使用快速的偷袭，相反刺客都喜欢使用缓慢移动的暗器。屏蔽场还能使空气流动变慢，所以可以防御毒气的袭击，给人逃脱的机会。如果使用激光枪攻击打开屏蔽场的人，很有可能受伤的会是自己。而且，在厄拉科斯上一般不会开启屏蔽场，因为它的噪音会引来超级大怪兽沙虫。
另一边，哈克南的飞行员按照指令把捆住的杰西卡和保罗带进沙漠，想借助杀虫毁尸灭迹。为了防备杰西卡的言音术专门派了一个聋子执行这个任务，还派了另一架扑翼机跟在后面监视，以确保万无一失。结果当然是没有用，还是被这对母子逃出生天。之前被派去监视杰西卡的邓肯也按照岳的提示截了一架扑翼机找到了母子二人，并带他们去找列特。三人来到一座生态研究基地，可是没多久这里就被攻破了。邓肯战死，列特让保罗和杰西卡从一个密道逃走。保罗驾驶扑翼机开进了风暴中。列特留下来用蝙蝠给弗雷曼人送信，要他们去找保罗母子二人。之后列特就被抓了，他们脱掉了列特的蒸馏服，把列特丢进了沙漠让他脱水而死。
雷托公爵的门泰特杜菲也被俘了，男爵的门泰特刚被毒死，于是他就想要杜菲为他服务。男爵给杜菲下了毒，每天都要服用特制的解药才能活命。当然，杜菲并不是想要苟且偷生，他仍然认为是杰西卡出卖了雷托公爵，所以他想要报仇，只好暂时忍辱负重。
雷托公爵还有一位武器大师哥尼·哈莱克，他以为厄崔迪已经全军覆灭了，就跑去加入了弗雷曼走私犯。
保罗和杰西卡从风暴中成功的脱身，又在沙漠里走了很久，他们在一个洞穴里遇到了之前和邓肯“吐口水”结盟的斯第尔格。因为有列特提前送来的信，再加上杰西卡答应教他们武术，弗雷曼人收留了保罗和杰西卡。当然，更重要的是弗雷曼人觉得保罗就是传说中的那个会带领他们走向伟大复兴的“指路之人”。
有一天，一个弗雷曼人对保罗发出了决斗挑战，保罗在决斗中杀死了他。按照弗雷曼传统，保罗从此就不再是个孩子了，要有一个属于战士的名字，保罗根据自己梦中的预言选择了穆阿迪布这个将要成为新的弗雷曼宗教领袖的名字。
按照弗雷曼传统，平时有人死亡，他身上的水分要蒸馏出来成为部落的公共财产，而在决斗中死掉一方的水是要属于胜利者的。所以保罗就得到了死者的33升水。弗雷曼人有一种记水器，凭这个计水器可以从部落的蓄水池里取一定量的水。而负责计水的正是列特的女儿契尼，也就是出现在保罗梦里他的未来的爱人。
契尼把计有33升水的金属环交给保罗，结果保罗这时候还傻傻的让契尼代为保管，他不知道这在弗雷曼文化中就是一种求爱的方式。沙丘因为出产香料成为帝国最重要的行星。然而，对于生活在这里的人来说，水才是重中之重。
这里简单说一下厄拉科斯的生态系统。厄拉科斯上最重要的生物就是沙虫，体长可达400米，在沙漠里自由穿行，来去无踪，一口可以吞下一个香料工厂。沙虫的幼体叫做沙鲑，根据描述应该是可以变形的软体生物，亲水，会吸收大量的水分并且囤积在体内。所以沙鲑大量繁殖就会使环境中的水越来越少，当地表完全沙漠化的时候，沙鲑就开始转变成沙虫形态。厄拉科斯的沙漠气候就是这样形成的。成为沙虫后，就从亲水变成恐水。沙虫只能在干燥的环境里生存，因为水对沙虫来说相当于毒药。沙虫生长到一定阶段会以半植物半生物的形态生存在沙地深处，称为小小造物主，有点像冬虫夏草。小小造物主的排泄物形成香料菌丛。香料菌丛遇水菌体会疯狂地生长。在这个阶段，香料会发生一次“爆炸”，将地下深层的物质掀出地表。当香料菌丛暴露在阳光和空气中后，就会变成美琅脂。总之香料的形成离不开沙虫，而沙虫离不开干燥的环境。所以，对于厄拉科斯来说，要水就不能要香料。水和香料不可兼得，这就是弗雷曼人面临的两难境地。
斯第尔格想让杰西卡接替部落里老圣母的位置，这里的圣母和BG的圣母不是一回事儿。于是老圣母让杰西卡喝下了生命之水作为考验。生命之水是沙虫在被淹死时释放出的液体，非常的凶险。杰西卡再次运用姐妹会的技能，在体内对有毒物质进行的转换。结果生命之水帮助她进入心灵合一的状态，让她进入一种催眠状态，并且获得了BG所有女性祖先的记忆。这样，杰西卡同时也升级到BG圣母的级别。而且，此时杰西卡已经怀孕，怀的就是将来保罗的妹妹厄莉娅。在杰西卡腹中的厄莉娅也进入了心灵合一的状态，在出生之前就不仅获得了女性祖先的记忆，还获得了男性祖先的记忆，被称为尖刀圣厄莉娅。
哈克南男爵重新夺回了对沙丘的管辖权，又派他的侄子野兽拉班去管理沙丘，更变本加厉的压榨弗雷曼人，从而在香料贸易中获得更多的利润。男爵的继承人，他的另一个侄子菲德-罗萨经常听变节门泰特杜菲的建议，名声要比拉班好很多，男爵打算让拉班控制住局面以后再让菲德接手。
菲德还是姐妹会配种计划里重要的基因携带者，有一个伯爵夫人是BG，打算去勾引他并获得他的基因。菲徳企图刺杀男爵未遂，男爵苦于没有更好的继承人，只是惩戒了一下菲徳，并向菲徳透露他觊觎皇帝宝座的野心。
在茫茫沙海之中保罗也开始用宗教信仰领导弗雷曼人。因为长期摄入香料，保罗的预知能力大幅提升，他根据自己的预言做出行动，力量不断壮大。期间保罗和契尼第一个儿子雷托二世也出生了，为了彻底融入弗雷曼人，保罗还学会了驾驭沙虫的技术。加入走私犯的哥尼·哈莱克也回到了保罗身边。于是保罗率领弗雷曼人开始了反抗野兽拉班的战争。
实际上从一开始发生在沙丘上一切都在宇航公会眼皮子底下，因为他们有许多飞船和卫星在天上。无论谁胜谁败，宇航公会都不在乎，他们在乎的只有香料，直到保罗发现破坏香料产生的方法。宇航公会到处散播谣言，诋毁保罗在沙丘所做的一切，又大幅调低军队运输费用，使得最穷的家族也能跑沙丘，等着参加瓜分厄拉科斯的战争。公会最好的领航员全都在寻找保罗，想要除掉他。
最后帕迪沙皇帝沙达姆四世带着他的萨多卡军队来到沙丘。保罗带人在风暴的掩护下袭击了皇帝驻扎的宫殿，同时自己后方的营地也遭到了萨多卡的袭击，保罗的儿子雷托二世被杀，保罗的妹妹厄莉娅被俘虏。原来厄莉娅是故意被俘虏的，她被抓过去之后直接就刺杀了哈克南男爵，千万不要以为她还是一个小女孩，这可是一个在娘胎里就已经无所不知的人物。
终于皇帝也迫不得已要跟保罗做出最后的了断了。皇帝先是命令杜菲去刺杀保罗，杜菲当然不会下手，于是死在保罗的怀里。然后哈克南的继承人菲德要跟保罗决斗，他居然在自己的屁股里装了一根毒针。保罗并没有中招，一刀刺穿下巴结果了他。
保罗这么厉害，又控制了香料，所以宇航公会和姐妹会的人都不敢出来说话了。皇帝只好让出皇位，并且把女儿伊勒琅公主嫁给他，还把皇家在宇航公会的全部股份作陪嫁。这个伊勒琅公主就是每一章开头那一段史诗的作者。之后，保罗把退位的皇帝就被放到训练萨多卡的监狱星球，把卡拉丹分封给了哥尼·哈莱克。
《沙丘》第一部的故事到这里就结束了。表面上这是一个类似王子复仇记的故事，赫伯特在里面加入预言的元素之后就把它变成一个充满宿命感的悲剧。保罗一步一步通过预言的实现完成复仇大业，同时他又深深地畏惧这个结果。
第一次经历到的那可怕目的的种族意识又不断撩拨着他。他发觉自己已经不再恨贝尼·杰瑟里特，不恨皇帝，也不恨哈克南人。他们都纷纷陷落在各自种族的需求中，为了更新散落的遗传因子，为了在一个更大更新的基因池中配对，融合和改进血缘体系。而种族只知道一种可靠的办法——那种经过千锤百炼，所经之路无一漏过的古法：圣战。
保罗意识到自己的确就像是一粒种子。
第二部《沙丘救世主》
在《沙丘》第一部的结尾保罗做了皇帝，被弗雷曼人奉若神明。但他的内心却非常不安。因为他之前的预言都实现了，他在预言里还看到了一场恐怖的圣战。
尽管保罗非常不愿意看到圣战的爆发，在他成为皇帝之后，这场残酷的战争还是发生了。弗雷曼人在对穆阿迪布的狂热信仰中开始了远征，战火蔓延至帝国的每一颗行星。他不情愿被人当做神一样崇拜，但为了维持稳定，又不得不接受这样的角色。
帝国里还有一些人对保罗的统治感到不满，于是召开一场密谋刺杀保罗的秘密会议。参加这场会议的有杰西卡的老师BG的老圣母盖乌斯·海伦·莫希阿姆，伊勒琅公主也就是保罗的皇后，她也是一位BG。姐妹会一直想得到保罗的基因，但是保罗拒绝和伊勒琅公主生孩子。
参加会议的还有一个宇航公会的领航员，他的作用是屏蔽保罗的预知能力，因为领航员和保罗都无法出现在对方的预知之中。此外，还有一个变脸者，他们来自特莱拉，有点像《权利的游戏》里的无面者，能够变成任何人的模样。实际上马丁老爷有很多情节都致敬了《沙丘》，而且国外很多大佬都以致敬《沙丘》为荣，恨不得直接告诉大家:你看，我这段是抄的《沙丘》。
特莱拉是一个神奇的星球，那里不仅以以培养变态的门泰特而闻名，他们还掌握了克隆和基因改造技术。特莱拉人从宇航公会那里买到战死的邓肯·艾达荷的尸体，然后克隆出了一个新的邓肯，起名叫海特，再把海特当做礼物送给保罗，等待时机操控海特来刺杀保罗。
经过特莱拉人改造过之后，海特拥有了门泰特的计算能力，却没有之前的记忆，于是很希望能找回之前的记忆然后变回邓肯。海特仍然保持着对厄崔迪家族的忠诚，所以被送过去之后就劝保罗把自己扔掉，但保罗还是坚持把他留在了身边。保罗的妹妹厄莉娅爱上了忠诚的海特。
与此同时，帝国暗潮汹涌，危机四伏。宇航公会得知沙虫和香料之间的联系，企图抓走一条沙虫走私到别的星球，然后培植香料。还有人在暗中推广塔罗牌。预知就像一潭水，有人进行预知就会造成轻微的扰动。所以用塔罗牌占卜的人太多，就会把水搅混，从而影响保罗的预知能力，然而保罗还是预见了契尼的死亡。
伊勒琅公主暗中给契尼下药，阻止她怀孕。保罗知道了却也不生气，只是将计就计，因为这就是厄崔迪的光荣传统……nonono！保罗预见到契尼是在生产的时候死的，所以伊勒琅公主下药实际上是推迟了契尼的死亡。
这一天有一个弗雷曼女孩儿跑来求见保罗，要保罗和契尼一起见她的父亲，因为他手里有弗雷曼人反叛的情报。保罗一眼就看出她是一个变脸者，因为这个女孩和先前死在沙漠里女孩长得一模一样。保罗又一次将计就计，还是跟着变脸者去了。不过幸好他没带契尼一起。
女孩的父亲把一个由特莱拉制造的侏儒交给保罗，说这个侏儒知道所有反叛者的名字。保罗离开的时候遭到了熔岩弹袭击，丧失了视力。按照弗雷曼的传统，瞎子是要被扔到沙漠里去自生自灭的，因为资源有限，部落没有办法养着这种失去生存能力的人。所以斯第尔格劝保罗隐瞒，保罗却说自己没有瞎，还像以前一样行动自如。因为保罗能够借助预知能力看到眼前的一切。
侏儒其实是特莱拉人送过来控制海特的，他们也预先得知了契尼的死，于是想控制海特给保罗提出可以让特莱拉人克隆契尼的建议。并且趁保罗思维混乱的时候杀死保罗，连保罗一块克隆，然后在背后进行操纵。
结果契尼死讯传来，在保罗身边的海特接收到杀死保罗的命令开始和他的忠诚发生冲突。短暂的混乱之后，忠诚战胜了命令，并且海特居然找回了曾经属于邓肯的记忆，变成了真正的邓肯。
邓肯陪同保罗一起去看契尼，发现契尼生出的是一对龙凤双胞胎，然而保罗在他的预言里只看到一个孩子。在听到孩子的哭声的时候，保罗突然丧失了他的预知能力。
此时，厄莉娅也来了，带来了之前假扮弗雷曼女孩的变脸者。她借口可以帮保罗克隆契尼，却突然劫持了双胞胎。关键时刻保罗又能看见了，原来他和儿子的视力联通了，趁机用飞刀杀死了变脸者。
保罗给自己的儿子起名叫雷托，女儿起名叫甘尼玛。这两个孩子都跟他们的姑姑尖刀圣厄莉娅一样生下来就有祖先的记忆。这件事之后，保罗是瞎子的事就曝光了，他决定遵照弗雷曼的传统，自我流放，独自走进了茫茫沙海。《沙丘救世主》到这里就结束了，在第一部里保罗害怕和担心的事都发生了，没有人能理解这个强大的皇帝有多无奈，直到他走进沙漠的那一刻，终于可以解脱了。一个圆满的结局可以是悲伤的，一个悲伤的结局却可以是超脱的。
第三部《沙丘之子》
因为保罗出走，留下两个小孩，所以只好由厄莉娅出任摄政女王，她和邓肯结了婚。因为推行环境改造政策，弗雷曼人在沙丘上建了许多蓄水池，并且在里面养食肉鱼。这样沙虫的幼体沙鲑就没办法进来吸水，沙虫活动的范围也越来越少，渐渐出现了一些绿洲，生存环境也不再像以前那样恶劣了。
第三部《沙丘之子》一开始，厄拉科斯上突然出现了一个瞎子传教士。人们传说自我流放到沙漠的保罗回来了，这个传教士就是保罗。传教士的活动威胁了厄莉娅的统治，厄莉娅下令要逮捕传教士，却因为传教士的追随者太多而成为一纸空文。
这时候杰西卡也从老家卡拉丹来到厄拉科斯，因为她听说厄莉娅的意识已经被她的外祖父哈克南男爵占据。这里解释一下，哈克南男爵也在姐妹会的配种计划里，曾经有BG取得他的基因生下一个女儿，然后交给姐妹会培养长大，就是杰西卡。男爵是杰西卡的父亲，也就是厄莉娅的外祖父。厄莉娅生下来就有所有祖先的记忆，其中就包括男爵的记忆。这些记忆互相打架，最后男爵占了上风，控制了厄莉娅。
杰西卡一到沙丘就处理了一批忠于厄莉娅的手下，还派了哥尼·哈莱克去找弗雷曼走私贩调查传教士的事情。当年厄崔迪家族一败涂地之后，哥尼曾经做过一段时间走私贩。
雷托和甘尼玛一起来到他们两个人的秘密基地，分别让意识里保罗的记忆和契尼的记忆控制他们的身体，这样不必借助香料就可以预见未来。于是雷托得知保罗会去迦科鲁图，而自己必须走上“金色通道”，才能使人类得救。
然后他们还想问怎样才能避免重蹈厄莉娅的覆辙，保罗回答说，没办法。之后雷托请求保罗代替他控制自己的肉体，也就是说让自己变成保罗。这里作者大力渲染了保罗的意志力有多强大，才能抵抗住这种诱惑。可能他忘了保罗还没死这件事，如果雷托变成保罗，那么将会同时存在两个保罗，不知道这算不算bug。
不过，没在雷托身上发生的事，在甘尼玛身上发生了。死去的契尼不想离开甘尼玛的身体，雷托软硬兼施，好一通嘴遁才说服老妈放弃霸占自己女儿的身体的想法。
话说，姐妹会一直也想得到两兄妹的基因，他们希望两个人能够配种，然后生出一个孩子，姐妹会就可以偷偷带走然后加以利用。雷托和甘尼玛为了避免这种事情发生的可能，两个人决定分开行动。
当年帕迪沙皇帝沙达姆四世的大女儿伊勒琅公主嫁给保罗做了帝国的皇后，他还有个二女儿文希亚跟着他一起被流放到监狱星球萨鲁撒·塞康达斯。文希亚公主生下一个儿子法拉肯，就想将来让法拉肯做上皇帝宝座，于是训练了两只老虎，用来刺杀雷托和甘尼玛。具体方法就是给老虎喂穿着特制衣服的小孩，然后把这种衣服进贡给雷托和甘尼玛。但是，这些都是瞒着法拉肯做的。
自从杰西卡来到厄拉科斯之后，受到各大部落的拥戴，还总是跟厄莉娅作对。厄莉娅终于下决心要除掉自己的亲妈，当然，也可以说是亲爹想弄死自己的亲女儿，因为此时的厄莉娅实际上是哈克南男爵。
厄莉娅请杰西卡代替自己主持朝会，她事先安排了杀手，正好前来请愿的是忠于杰西卡的弗雷曼敢死队，于是护送杰西卡安全逃走。随后遇到厄莉娅的丈夫邓肯，他在这里是多重间谍。首先，厄莉娅派邓肯把杰西卡绑架到萨鲁撒·塞康达斯，好嫁祸给她妹妹文希亚。然而，邓肯也早觉察到厄莉娅有问题，于是听从了传教士的安排，将计就计，要把杰西卡带到萨鲁撒·塞康达斯去用贝尼·杰瑟里特的方式训练法拉肯。杰西卡是听了雷托的预测，将计就计，就跟邓肯走了。
另一边，雷托和甘尼玛躲在一个狭小的山洞里等待老虎的出现，甘尼玛被抓伤，但他们还是成功杀死了老虎。然后按照计划，两个人从此分道扬镳。雷托去找传说中的迦科鲁图，甘尼玛自我催眠让自己相信雷托已经被老虎吃了，并且带着噩耗独自回去，以防面对厄莉娅时露出破绽。
雷托遇刺，传闻说是文希亚绑架了杰西卡，这让法拉肯很生气。他决定放逐母亲文希亚，来平息舆论。同时杰西卡也答应澄清自己并没有被绑架，还同意让法拉肯娶甘尼玛，然后做帝国的皇帝。
在厄拉科斯的牺牲日这一天清晨，传教士再次出现在厄莉娅神庙的广场上。他发表了与穆阿迪布教义完全相反的演说。穆阿迪布靠预言统治帝国，相信一切都是确定的，但是传教士却说:“人必须永远选择不确定性，远离确定性。”厄莉娅认出了传教士就是保罗。
雷托在沙漠里一连走了好几天，终于来到迦科鲁图。哥尼·哈莱克也在这里，他和这里的部落首领一起控制了雷托，并且强行给雷托注射了香料。部落首领是厄莉娅的人，厄莉娅早就想给雷托和甘尼玛使用香料了。因为这两兄妹是目前为止唯二不靠香料就能预测未来的人类，厄莉娅想看看香料会在他们身上发挥什么样的效果。哥尼本来是杰西卡派来调查传教士的，部落首领骗他给雷托使用香料是杰西卡的命令。
果然，在香料的作用下雷托开始进化，当然也多亏有保罗强大的记忆全程护持，雷托终于打通任督二脉，让自身的过去记忆和未来预知形成了统一的整体，开了天眼。
部落首领派自己的女儿负责看守，雷托看到未来的自己会跟她相爱，果断避开了这条时间线，趁机逃走，于是这个女人在小说里再没出现过。。
沙达姆家族提出联姻请求，甘尼玛因为自我催眠对雷托之死深信不疑，坚决不同意嫁给法拉肯，并说会亲手杀掉法拉肯。厄莉娅觉得杀了也没什么不好，就先替甘尼玛答应下来。邓肯也被送了回来，厄莉娅居然要除掉自己的丈夫。于是派他去找斯第尔格，安排人在路上制造事故。邓肯发现不对劲，劫持了一架扑翼机逃脱，自行去找斯第尔格。厄莉娅众叛亲离，只有斯第尔格还保持中立。邓肯故意激怒斯第尔格，被他杀死。斯第尔格杀了厄莉娅的丈夫，没办法继续保持中立，于是带着甘尼玛一起逃走。
雷托来到一个走私沙虫的部落，他在这里让沙鲑覆盖身体，和自己的皮肤融为一体，形成活的蒸馏服。这让他的身体机能大幅提高，同时获得超长的寿命。雷托继续他的“金色通道”之路，四处破坏蓄水池，阻止沙丘生态的转变。但是为时已晚，沙漠就要完全消失，沙虫也失去了栖息地，没有了沙虫，也就不会再有香料产出。雷托的破坏只能推迟这一天的到来。
雷托在沙漠里遇到父亲保罗，带着他回到迦科鲁图，在这里和哥尼会合，重建蓄水池，并且开始囤积香料。等生态环境彻底发生变化以后，香料产量将会大幅下降，直至停止。到时候雷托就可以依靠囤积下来的香料统治帝国了。
厄莉娅派人去跟斯第尔格谈判，趁机绑走了甘尼玛。杰西卡也带着他的好学生法拉肯，一名男性BG来到厄拉科斯要和甘尼玛举行订婚仪式。
这时候传教士又出现在外面的广场上，揭露厄莉娅的罪行。结果引起骚乱，几名厄莉娅的追随者趁机杀死了传教士，保罗的一生终于结束。
和保罗一起来的雷托解除了甘尼玛的自我催眠，凭借超能力制服了姑姑厄莉娅。大家想帮助厄莉娅恢复自己的意识，可惜没能成功，厄莉娅自己从窗户跳下去死掉了。杰西卡在同一天目睹自己的儿子和女儿双双死去。
雷托正式称帝，从此统治了帝国长达四千年，被称为神帝雷托。法拉肯交出自己的军队，和甘尼玛结了婚。《沙丘之子》到这里就结束了。
第四部《沙丘神帝》
接下来是第四部《沙丘神帝》，主要讲雷托对帝国的统治，也是六部曲中内容最隐晦最艰深难懂的一部。
帝国在雷托的治下，出现了长久的和平，虽然这种和平是靠威权统治来维持的。随着时间的推移，雷托身上的沙鲑开始发育成沙虫，最后就只剩下一张人脸和两只退化的手臂。
厄拉科斯的生态改变也已经完成，沙漠完全消失，沙虫也灭绝了。整个帝国的香料就只剩下雷托手上的库存。各大势力陷入恐慌，姐妹会的育种计划也被雷托掌控。雷托毫不顾忌随意使用来自伊克斯星球的高科技，用思维读取技术写日记，出入乘坐自动悬浮御辇。而且他还让特莱拉人不断地克隆邓肯，死一个就让再送一个过来。这些邓肯都继承前一代的记忆，所以知道自己一次又一次都是怎么死的。另外比如焚书坑儒的事就更不在话下。雷托为防止叛乱，还专门建立了一支女性军队，鱼言士。
就在培养鱼言士的学校里出现了一个反叛军的首领赛欧娜。赛欧娜的父亲莫尼奥原来也是叛军，因为很聪明，又同情雷托且缺乏斗争的勇气，就被雷托劝降做了雷托的总管。实际上他们父女是甘尼玛和法拉肯的后代，都是雷托育种计划里的厄崔迪后人，在某一代中还混入了邓肯的基因。雷托总是在反叛者中挑选人才，让他们臣服，并且加入配种计划全家桶。
话说塞欧娜和几位反叛军潜入了雷托的地堡，偷走了雷托的日记和地堡的平面图。撤退时被发现，雷托放狼追击，同伴都被咬死，赛欧娜跳进河里才逃掉。
雷托的日记是用密码写的，塞欧娜就把日记复制了很多份交给了帝国中的各路人马，比如姐妹会、宇航公会、伊斯克星等，希望有人能破译。
邓肯在汇报盗窃事件的时候，企图用激光枪刺杀雷托，然而激光枪根本伤不了雷托神帝，邓肯被雷托一个翻身就压扁了。很快伊克斯就送来新的邓肯，雷托打算让邓肯和赛欧娜配种。因为全知全能的雷托在他的预言里唯独看不到赛欧娜。
莫尼奥也担心女儿的安全，请求雷托用展示黄金通道的方式劝降赛欧娜，就像当年考验自己那样。
在前往庆典的路上，雷托遭遇变脸者的袭击。因为变脸者来自特莱拉，作为惩罚，雷托当众鞭打特莱拉派来参加庆典的大使，并且取消了他们下一个十年全部香料的配额。
邓肯质疑雷托的做法，说鞭刑绝非厄崔迪人所为。雷托说，他这是在给大家上课，内容叫做《论军事蠢行的自杀性实质》。之前，因为上一个邓肯刺杀雷托使用的是来自伊克斯的激光枪，当时雷托也驱逐了伊克斯的大使，他们重新派来的是一位女大使，叫赫娃·诺里。伊克斯特意把赫娃培养成一个完美的女人，用来打动雷托。雷托对这些阴谋了然于心，但是仍然爱上了赫娃。众所周知，将计就计是厄崔迪家的光荣传统。
与此同时，姐妹会派来的两位圣母，她们之前提醒鱼言士说特莱拉人可能要刺杀雷托。其实姐妹会也有自己的计划，她们带了一瓶香料萃取物美琅脂，因为有传言说沙虫遇到美琅脂就会分裂成沙鲑。这点小伎俩雷拖一下就看穿了，收缴了美琅脂，鉴于她们有检举特莱拉阴谋的功劳暂且不予惩罚。
金色通道和帝王的孤独让雷托的内心痛苦不堪，赫娃的出现，使雷托的人性再次被唤醒。庆典当天，气氛非常热烈，雷托对所有鱼言士发表说:“我爱你们胜过任何人。”
邓肯陪同雷托从人群中走过，人们就挤过来伸手触摸他们。庆典之后，雷托再次召见了赫娃，两人互诉衷肠。雷托说他将会面临的死亡，自己虽然被称为神帝，统治帝国四千多年，但是他知道自己不可能永生，最后的结局就是分裂成许许多多的沙鲑，而他的意识将会分散并封闭在沙鲑之中，在沙虫的转变和繁衍中分裂下去。这就是金色通道的含义。赫娃对雷托报以深深的同情，并答应和他结婚。
城里又有变脸者发动暴乱，赫娃因此受伤。雷托暴怒，四处翻滚，压死了大片叛军。因为赫娃被伊克斯人改造的过于完美，邓肯也为之倾心。而且他出于正直的本性，竭力劝阻雷托和赫娃结婚。这让雷托很伤心。
赫娃曾经也对邓肯一见倾心，于是偷偷和邓肯滚了床单。但赫娃还是决定要嫁给可怜的雷托，对邓肯说这只是爱的告别。
在婚礼前，雷托决定让赛欧娜通过金色通道的考验。他让塞欧娜骑在自己身上，带她进入了地堡附近保留的沙漠，然后让赛欧娜靠自己走出沙漠。整个过程雷托就陪在赛欧娜身边，他要赛欧娜学会在沙漠中生存的技能，因为沙漠和沙虫将会回到厄拉科斯，到时候这里的人都必须学会如何在沙漠里生存。
塞欧娜在极度干渴的情况下接受了雷托身上分泌的香料，于是通过了厄崔迪人的香料考验。就在这时天上开始下雨，雷托被雨水伤的很重，不过他仍然跟赛欧娜讲解了沙虫和沙鲑，香料和水之间的关系。
沙虫的幼体叫做沙鲑，根据描述应该是可以变形的软体生物，它们非常的亲水，会吸收大量的水分并且囤积在体内。所以沙鲑大量繁殖就会使环境中的水越来越少，当地表完全沙漠化的时候，沙鲑就开始转变成沙虫形态。最初厄拉科斯的沙漠气候就是这样形成的。成为沙虫后，就从亲水变为恐水。沙虫只能在干燥的环境里生存，因为水对沙虫来说相当于毒药。而香料的形成离不开沙虫，沙虫离不开干燥的环境。所以，对于厄拉科斯来说，要水就不能要香料。水和香料不可兼得，这就是沙丘上的两难境地。赛欧娜也从中得出杀死雷托唯一可行的方法。
从沙漠里走出来之后，赛欧娜就算是通过了金色通道的考验，被任命为鱼言士的指挥官。莫尼奥了解女儿叛逆的性格，他求赛欧娜和邓肯不要参加雷托的婚礼，让他们躲去一个弗雷曼保留地小村庄。
结果雷托偏要把婚礼改到在那个村庄举办。婚礼当天，雷托乘坐御辇前往婚礼现场。赛欧娜和邓肯提前对御辇动了手脚，然后埋伏在中途的一座桥的附近。当雷托一行人走到桥上，命人用激光枪炸断桥梁，赫娃首先从桥上掉下，接下来是莫尼奥，他摔在岩石上死了，最后雷托也掉进了河里。一瞬间，他的身体上裹满了泡沫，冒着蓝色的烟，分裂成许多沙鲑四散游走了。雷托原本的肉体露了出来，被冲上岸。
千疮百孔的雷托并没有死，他对塞欧娜和邓肯说:这一回朕可不是将计就计，朕是真的预见不到赛欧娜的行动。也就是说赛欧娜的基因不在任何预知能力的探测范围之内，她和身边这个邓肯的后人将开启一个新的时代。雷托还交代了自己香料仓库的位置，最后化作几根骨头和一滩蓝色的液体。赛欧娜杀死了雷托，却也成为了金色通道的继承人。
雷托分裂出许多沙鲑，这些沙鲑慢慢又把厄拉科斯变回了沙丘原来的样子，沙虫又回来了，香料也重新在这里出产。沙丘上出现信仰雷托神帝的宗教，把雷托称为分裂之神。《沙丘神帝》的故事就此结束。雷托比保罗走得更远，承受的更多，更孤独。他的结局也是包括保罗在内所有伟大君主结局的一种艺术的演绎。
第五部《沙丘异端》
第五部《沙丘异端》一开始讲，雷托死后，帝国陷入混乱，发生了大饥荒。因为技术发展，伊克斯已经有了可以不被预知能力探测的飞船，称为无舰，特莱拉人也开发出能够量产的香料。于是有一部分人开始向宇宙更遥远的地方移民了。有了这些躲避预知能力的技术之后，那些去往宇宙深处的人类，渐渐就和留在核心区域的人类脱离了联系，史称大离散。
小说里写雷托分裂之后1500年，随着一些大离散出去的人类的后代再次回到核心区域，各大势力又展开了斗争。因为丰富的香料，姐妹会重新壮大，但是她们再也不敢培养魁萨茨·哈德拉克了，害怕再搞出下一个什么神帝出来。而离散回来的人类中有一群叫做尊母的女性领导者，她们是姐妹会成员的后人，有BG一样的技能和战斗力，还多了一项色诱术，就是通过性来控制男人。
特来拉变脸者也进化了，他们的伪装术变得更难识破，还可以在杀死对方后，读取他的记忆。姐妹会当然也开发了对应的药剂，能够产生谢尔效应，阻止死后的记忆被人读取。特莱拉的尊主巧妙的在谈判过程中杀死过一个尊母，并且研究了尊母的性控制能力，还让尊母误以为特莱拉人已经臣服于她们了。另外，特莱拉人开始信奉雷托神帝，称他为神的使者，并且继续供应克隆的邓肯给姐妹会。这些是专门定制的，都不带过去的记忆，身体机能也做了改造提升，叫做死灵邓肯。训练邓肯的基地在迦穆星，这里以前是哈克南的封地，大圣母施万虞派前任霸撒，米勒斯·特格训练死灵邓肯。
此时的沙丘的名字已经从厄拉科斯变成拉克斯，在拉科斯上出现了一个女孩，名叫什阿娜·布拉赫，拥有控制沙虫的能力。姐妹会训练死灵邓肯就是为了跟什阿娜配种来获取控制沙虫的基因。
在一次针对拉克斯的教会袭击中，姐妹会出手保护了什阿娜，从而接替了教会对什阿娜的监护权。姐妹会派特格的女儿达尔维·欧德雷翟训练什阿娜成为BG。
大圣母与特莱拉尊主之主马哈依特路易斯·瓦夫会面。因为猜测到特莱拉人杀过遵母，圣母以此要挟瓦夫分享特莱拉获得的关于尊母的情报。
后来，瓦夫又和姐妹会的欧德雷翟在拉科斯谈判，在场的还有拉科斯教会的主教。瓦夫用暗器杀死了主教，并把他替换成了一个变脸者。欧德雷翟反应迅速，躲开了暗器。因为姐妹会需要和特莱拉人结盟来对抗尊母，所以欧德雷翟就设计让瓦夫认为姐妹会也跟他们一样信奉雷托神帝。
欧德雷翟带着瓦夫和什阿娜走进了沙漠，一起骑上了沙虫，然后在沙虫体内残存的雷托的意识碎片的指引下，找到了雷托藏匿香料的仓库。作为交换，特莱拉人把尊母的性控制术演示给姐妹会看，还把量产香料的技术也教给姐妹会。
尊母派人袭击了迦穆，特格和死灵邓肯还有BG卢西拉，躲进了哈克南人很久以前建造的一个无厅。无厅和无舰一样，不会被预见能力看到。特格用门泰特的方式推算出应该先帮死灵邓肯恢复原始的记忆。大圣母派特格的学生，现任霸撒伯兹马利前来支援，在无厅外面两军相遇，展开激战。特格掩护邓肯和卢西拉逃走，自己却被尊母的人俘虏。
邓肯和卢西拉与伯兹马利会合后，打算分头乔装离开已经被离散之人占领的迦穆。卢西拉和伯兹马利一个扮妓女一个扮嫖客，居然跑去跟一个叫默贝拉的尊母套话，还被她误认为是高级尊母。默贝拉告诉他们，邓肯已经被抓住了，正准备对他使用性控制术，就安排卢西拉在窗户外面观摩。尊母的性控制术激发了特莱拉人预先给邓肯植入的反制武器，本来是准备对付姐妹会的，结果用到了尊母身上，默贝拉被邓肯反向控制了。
尊母的人对特格使用刑讯仪，想刺探他的记忆。因为特格注射过谢尔，阻止了刑讯仪对大脑信号的搜索和解读。他们把刑讯仪开到最大功率，特格在极度痛苦中被激发出超能力，感官和动作变得极度迅捷，周围的世界在他的感觉里变得非常缓慢。特格解开绳子，轻松干掉一众喽啰。特格发现自己同时还获得了预知能力，而且无厅、无舰也阻挡不了他的探测。这得益于他强大的厄崔迪基因。超人特格所向披靡，带着一些新招募的追随者劫持了尊母的无舰，并且找到邓肯和卢西拉一同前往拉科斯。
尊母在拉科斯袭击了大圣母，大圣母被击中，临死前将自己的意识和记忆传输给欧德雷翟。欧德雷翟带着什阿娜骑上沙虫逃进沙漠。特格赶到拉科斯和她们回合，利用什阿娜的能力把一条沙虫带上了无舰，欧德雷翟带领众人驾驶无舰飞向姐妹会的大本营圣殿星球。特格留下来断后，被愤怒的尊母连同拉科斯星上的所有生物一同摧毁。
原来拉科斯的毁灭是大圣母早就计划好的，大圣母认为拉科斯上的沙虫都保留着神帝雷托的记忆碎片。雷托虽然死了，但是通过这些记忆碎片仍然左右着人类的未来。只有摧毁拉科斯才能将人类从雷托的手中彻底解放，让人类自由的发展。等到幸存的沙虫再度生息繁衍的时候，人类就有能力突破雷托的控制了。只不过大圣母原先计划的是用死灵邓肯作为诱饵，最后特格改变了计划代替邓肯死掉了。第五部《沙丘异端》到此结束撒花。
第六部《圣殿沙丘》
尊母带着离散归来的军队扫荡了整个旧帝国的核心区域，几百万颗星球都被他们攻占，屠杀这些星球上的姐妹会，战火马上就要烧到圣殿星球了。第六部《圣殿沙丘》开始，欧德雷翟当上了大圣母，她和什阿娜按照计划正在将圣殿星球改造成新的沙丘。预感到熊熊战火正在逼近，为了避免遭遇灭顶之灾，她们也开始了自己的离散计划。圣殿星球上的姐妹会选出一波又一波圣母，按照欧德雷翟的指示去往未知的宇宙深处。
邓肯和默贝拉因为不是赛欧娜的后代，会被尊母的预知能力发现，所以一直被关在带他们来到圣殿星球的那艘无舰里，关在一起的还有最后一个特莱拉尊主斯凯特尔。特莱拉星也被尊母扫荡，斯凯特尔是唯一幸存者，他身上有一个小小的储存设备，藏着大量的特莱拉人的细胞，等待时机光复特莱拉。邓肯和默贝拉虽然是靠各种阴谋诡计才走到一起的，但是两人非常恩爱，一共生了四个孩子，后来都被姐妹会给带走了。邓肯慢慢也恢复了从最原始到后来每一代死灵邓肯所有的记忆。
圣母卢西拉所在的星球也被攻占，只有卢西拉自己逃了出来，她通过姐妹会记忆分享的方法带着所有圣母的记忆逃到了迦穆星。在这里遇到了一个犹太人女孩吕蓓卡，她也是一位野生BG。卢西拉又把7622014位圣母的记忆传给吕蓓卡，然后吕蓓卡带着她们去到圣殿星球把记忆交还给了姐妹会。
卢西拉被尊母抓走之后，并没有马上被杀死。大尊母想从她身上获得姐妹会对自身生化反应的控制能力。有推测认为他们之所以从离散的宇宙深处回到旧帝国，可能就是由于受到了使用生化武器的敌人的驱赶。卢西拉当然不肯透露任何线索，被大尊母一脚踢死，尸体喂给混合人吃掉了。
混合人是一种半人半兽的种族，非常凶残，但是没什么智力，只能用少量的简单词汇交流。尊母把抓到的混合人关进笼子当宠物。根据欧德雷翟的推断，混合人应该也是在离散区域用来驱赶尊母的武器之一。有一些离散区的混合人曾经和姐妹会进行了接触，试图和姐妹会结盟共同对付尊母。
欧德雷翟派接触过混合人的圣母去跟尊母谈判，谎称姐妹会更愿意和遵母结盟，请求安排大尊母跟大圣母的会面。欧德雷翟打算用自己作为诱饵，趁机让死灵特格展开偷袭。
姐妹会不知道从什么地方搞到特格的基因，克隆出来死灵特格。为了恢复特格的记忆，让他能够担任霸撒的角色，欧德雷翟让邓肯负责训练特格。当年的学生反过来成为老师，老师则成了学生。邓肯通过自己的经验推测，啪啪啪就可以唤醒过去的记忆，完全不必像以前那样大动干戈。于是邓肯说服什阿娜和死灵特格啪啪啪，果然成功的恢复了特格的记忆。特格再次成为姐妹会的霸撒。与此同时，欧德雷翟亲自训练前尊母默贝拉成为一名圣母，获得了姐妹会的共同记忆。由于身份的转变，邓肯感受到他和默贝拉之间的爱的消失。这时邓肯也出现了类似预见未来时出现的幻觉。他看到了一对年老的变脸者夫妻，并且推测是他们制造了混合人。
后来，欧德雷翟启程去跟大尊母谈判。尊母对她不是特别重视。欧德雷翟终于见到了大尊母，蜘蛛女王达玛。
谈判过程中，一个尊母劳格诺送来两杯酒。看到大尊母喝了，欧德雷翟也尝了一口，发现只是是解除谢尔作用的药。欧德雷翟借机嘲讽了大尊母的手段卑劣。大尊母很生气，把劳格诺痛骂一顿，结果自己中毒死了，原来她的那一杯是毒酒。劳格诺成了新任大尊母。
这个时候特格按照计划也已经带着军队杀了过来，结果劳格诺轻易的就投降了，很明显这又是一个圈套。但是，你只能将计就计。
得到消息的默贝拉匆忙赶到，以尊母的身份混了进来，声称自己成功从姐妹会那里骗到了各种密术。经过验证，默贝拉被带去见劳格诺。凭借同时掌握对尊母和圣母两边的战斗技巧，默贝拉轻松战胜劳格诺，当上了大尊母。
欧德雷翟在混战中受伤，在死前把记忆传给默贝拉。默贝拉带着特格和一部分尊母回到了圣殿星球。此时，默贝拉既是大圣母又是大尊母，在她的领导下两股势力开始融合。
什阿娜对融合持怀疑态度，决定离开圣殿去开拓新的星球。她带着特格、邓肯、犹太女孩吕蓓卡、特莱拉尊主斯凯特尔还有一条小沙虫，乘坐无舰飞向茫茫宇宙。《圣殿沙丘》在此结束，沙丘六部曲也在看似没有完结之处完结了。
小说最后是作者弗兰克·赫伯特给亡妻写的讣告，赫伯特也在《圣殿沙丘》出版一年之后去世。他的儿子布莱恩·赫伯特整理了弗兰克·赫伯特的遗稿并与凯文·J·安德森合著了包括大结局在内的多部拓展小说，不提。