作者：孙啸 谢建明 周庆 等 日期：2021-07-14 14:56:12
POD产品说明：1. 本产品为按需印刷（POD）图书，实行先付款，后印刷的流程。您在页面购买且完成支付后，订单转交出版社。出版社根据您的订单采用数字印刷的方式，单独为您印制该图书，属于定制产品。2. 按需印刷的图书装帧均为平装书（含原为精装的图书）。由于印刷工艺、彩墨的批次不同，颜色会与老版本略有差异，但通常会比老版本的颜色更准确。原书内容含彩图的，统一变成黑白图，原书含光盘的，统一无法提供光盘。3. 按需印刷的图书制作成本高于传统的单本成本，因此售价高于原书定价。4. 按需印刷的图书，出版社生产周期一般为15个工作日（特殊情况除外）。请您耐心等待。5. 按需印刷的图书，属于定制产品，不可取消订单，无质量问题不支持退货。【编辑推荐】POD产品说明：1. 本产品为按需印刷（POD）图书，实行先付款，后印刷的流程。您在页面购买且完成支付后，订单转交出版社。出版社根据您的订单采用数字印刷的方式，单独为您印制该图书，属于定制产品。2. 按需印刷的图书装帧均为平装书（含原为精装的图书）。由于印刷工艺、彩墨的批次不同，颜色会与老版本略有差异，但通常会比老版本的颜色更准确。原书内容含彩图的，统一变成黑白图，原书含光盘的，统一无法提供光盘。3. 按需印刷的图书制作成本高于传统的单本成本，因此售价高于原书定价。4. 按需印刷的图书，出版社生产周期一般为15个工作日（特殊情况除外）。请您耐心等待。5. 按需印刷的图书，属于定制产品，不可取消订单，无质量问题不支持退货。【编辑推荐】新定价链接：R语言及Bioconductor在基因组分析中的应用从事统计分析或者生物信息学研究的工作人员和研究生，另外一类读者是其他领域的计算机应用人员【内容简介】本书是国内*本系统介绍R语言及Bioconductor软件包的图书。R是一种计算机程序设计语言，也是一个开放式的软件开发平台。R具有强大的数学统计分析和科学数据可视化功能，提供各种数据处理、统计分析及图形显示工具。软件研究人员可以在R这个开放平台上不断扩充R的功能，开发出面向特定应用的软件。Bioconductor就是一个基于R的、面向基因组信息分析的应用软件集合。Bioconductor的应用功能主要是以包的集成形式呈现在用户面前，它提供的软件包中包括各种基因组数据分析和注释工具，其中大多数工具是针对基因芯片或DNA微阵列数据的处理、分析、注释及可视化。同时，Bioconductor还提供许多与DNA微阵列相关的数据包。本书分为上下两篇，分别介绍R和Bioconductor软件包，介绍Bioconductor在基因组分析中应用。【目录】前言上篇 R语言第1章 R语言简介1.1 平台1.2 R语言的发展简史1.3 R语言和统计学1.4 运行R语言的环境及安装1.5 交互式使用R语言第2章 R语言的基本数据结构2.1 向量的赋值2.2 向量的基本运算2.3 构造向量2.4 逻辑向量2.5 字符向量2.6 复数向量2.7 获取向量子集和修正向量子集2.8 常量第3章 R语言对象3.1 对象的基本属性3.2 改变对象的长度3.3 获取对象的属性3.4 获取对象类第4章 分组因子4.1 分组因子4.2 聚集计算4.3 排序第5章 数组和矩阵5.1 定义数组5.2 数组子集操作5.3 构造数组5.4 数组计算5.5 矩阵5.6 数组矩阵合并5.7 定义数组的操作第6章 数据列表和数据单6.1 数据列表6.2 构造数据列表6.3 数据列表操作6.4 数据单第7章 导入导出数据7.1 高级函数7.2 低级函数7.3 命令台输入输出以及格式化7.4 使用R语言内含的数据集第8章 组合表达式和控制语句8.1 组合表达式8.2 控制语句第9章 函数9.1 排序的例子9.2 定义新的操作符9.3 参数名和参数缺省定义9.4 ‘...’形式的参数（虚参）9.5 函数和变量的作用范围9.6 类、通用函数和面向对象9.7 调试9.8 操作符号的优先级第10章 包10.1 标准包10.2 扩展包和CRAN10.3 包命名空间10.4 R语言中常用的包第11章 R语言中的统计11.1 R语言中的概率分布11.2 从离散数据集分析概率分布特性11.3 回归分析第12章 图形函数12.1 高级图形命令12.2 低级图形函数12.3 与图形进行交互12.4 利用图形参数12.5 图形参数列表12.6 设备驱动12.7 动态图形下篇 Bioconductor及其应用第13章 Bioconductor与DNA微阵列数据处理13.1 Bioconductor简介13.2 DNA微阵列13.3 微阵列数据处理与分析13.4 Bioconductor开发背景13.5 Bioconductor各种包的分类介绍第14章 Bioconductor的使用14.1 Bioconductor的获取和安装14.2 Bioconductor快速入门14.3 Bioconductor应用实例第15章 数据库访问15.1 Rdbi软件包15.2 RdbiPgSQL软件包15.3 SAGElyzer软件包第16章 图形及用户接口16.1 widget Tools包16.2 tk Widgets包16.3 geneplotter包16.4 hexbin包16.5 limma GUI包16.6 affylm GUI包16.7 webbioc包第17章 图结构17.1 graph包17.2 RGBL包17.3 Rgraphviz包17.4 SNAData数据包第18章 通用工具18.1 repos Tools包18.2 Biobase包18.3 Biostrings包18.4 DynDoc包18.5 Ruuid包18.6 ctc包18.7 convert包18.8 Icens包18.9 expr External和external Vector软件包第19章 注释19.1 annotate包19.2 AnnBuilder包19.3 Resourcer包19.4 SNPtools包19.5 Data packages包第20章 基因本体学20.1 go Tools包20.2 onto Tools包20.3 GO stats包第21章 微阵列数据预处理21.1 affy包21.2 affycomp包21.3 affydata包21.4 affypdnn包21.5 affyPLM包21.6 gcrma包21.7 makecdfenv包21.8 annaffy包21.9 marray包21.10 matchprobes包21.11 vsn包第22章 数据分析22.1 daMA包22.2 edd包22.3 factDesign包22.4 genefilter包22.5 globaltest包22.6 gpls包22.7 multtest包22.8 pamr包22.9 Measurement Error.cor包22.10 limma包22.11 ROC包22.12 siggenes包22.13 splicegear包22.14 RMAGEML包第23章 微阵列比较基因组杂交23.1 aCGH包23.2 DNAcopy包第24章 蛋白质组学24.1 PROcess包24.2 gpls包24.3 apComplex包主要参考文献附录 R语言常用功能一览表